Согласно пояснительной записке, центр нужен для внедрения «современных и наиболее эффективных» технологий специализированной помощи больным с онкологическими и сердечно-сосудистыми заболеваниями, а также для расширения объема ВМП, научных и научно-клинических исследований в области радиоизотопной визуализации и радионуклидной терапии.

В ЦВМТ планируют разместить стационар на 80 коек, блок с пятью операционными и реанимационные палаты на 12 коек. Общая площадь объекта составит 18,1 тысячи кв. м, в здании будет семь этажей.

Градостроительно-земельная комиссия Москвы согласовала проект строительства ЦВМТ в начале августа 2019 года. Кроме того, на расширение и реконструкцию корпусов НМИЦ, по Федеральной адресной инвестиционной программе, до 2021 года планировалось направить около 500 млн рублей.

В конце сентября 2019 года премьер-министр РФ Дмитрий Медведев подписал постановление Правительства РФ о выделении из федерального бюджета субсидии в 7,8 млрд рублей на «реконструкцию и развитие» второй очереди НМИЦ им. академика Е.Н. Мешалкина. Как и в случае с НМИЦ им. А.В. Вишневсого, средства должны быть освоены до 2023 года, а сдача объекта в эксплуатацию назначена на 2024 год.